測(cè)定核酸含量的方法及原理
核酸,作為承載生命遺傳信息的核心物質(zhì),其含量的精準(zhǔn)測(cè)定在生命科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)診斷、生物技術(shù)等領(lǐng)域至關(guān)重要。無(wú)論是進(jìn)行基因表達(dá)分析,還是質(zhì)量控制,了解樣本中核酸的多少都是第一步。那么,實(shí)驗(yàn)室中是如何對(duì)核酸含量進(jìn)行測(cè)定的呢?其背后的科學(xué)原理又是什么?本文將帶您了解幾種常用的測(cè)定核酸含量的方法及原理。
一、紫外吸收法:簡(jiǎn)便快速的經(jīng)典方法
原理介紹:
紫外吸收法是測(cè)定核酸含量的方法及原理中最為經(jīng)典和便捷的一種。其核心依據(jù)是核酸分子中的堿基(嘌呤和嘧啶)對(duì)特定波長(zhǎng)的紫外光具有吸收作用。在260納米波長(zhǎng)下,核酸的吸收峰最為顯著。通過(guò)使用紫外分光光度計(jì)測(cè)量樣本在260nm處的吸光度值,再根據(jù)朗伯-比爾定律,即可計(jì)算出核酸的濃度。純DNA的A260值為1時(shí),大約相當(dāng)于50μg/mL的雙鏈DNA濃度。
方法與特點(diǎn):
此方法操作簡(jiǎn)單,無(wú)需消耗樣品,測(cè)量后樣本可回收。它不僅能給出濃度,還能通過(guò)A260/A280的比值初步判斷核酸的純度(純DNA比值約為1.8,純RNA約為2.0)。然而,該方法易受到蛋白質(zhì)、苯酚等污染物的干擾,這些物質(zhì)也會(huì)吸收紫外光,從而影響核酸含量測(cè)定的準(zhǔn)確性。
二、熒光染料法:高靈敏度的選擇
原理介紹:
當(dāng)對(duì)微量或純度不高的樣本進(jìn)行核酸含量測(cè)定時(shí),熒光染料法展現(xiàn)出其高靈敏度和特異性優(yōu)勢(shì)。該方法利用某些熒光染料(如PicoGreen用于DNA,RiboGreen用于RNA)在游離狀態(tài)下熒光微弱,但一旦與核酸特異性地結(jié)合后,其熒光信號(hào)會(huì)呈數(shù)百倍增強(qiáng)的特性。
方法與特點(diǎn):
通過(guò)檢測(cè)熒光強(qiáng)度的變化,并與已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品曲線進(jìn)行比較,即可精確計(jì)算出待測(cè)樣本的核酸含量。這種測(cè)定核酸含量的方法及原理極大地提升了檢測(cè)的靈敏度,可以檢測(cè)到皮克級(jí)別的核酸,并且抗干擾能力強(qiáng)于紫外吸收法,非常適合復(fù)雜樣本中的核酸含量測(cè)定。
三、瓊脂糖凝膠電泳:半定量的直觀方法
原理介紹:
瓊脂糖凝膠電泳雖然通常被視為定性分析手段,但同樣可以作為一項(xiàng)輔助的核酸含量測(cè)定方法。其原理是核酸分子在電場(chǎng)中會(huì)向正極移動(dòng),分子量不同的核酸片段在凝膠基質(zhì)中遷移速率不同,從而得以分離。
方法與特點(diǎn):
將待測(cè)核酸樣本與已知濃度的DNA標(biāo)準(zhǔn)品(Marker)在同一塊凝膠上加樣電泳。電泳結(jié)束后,使用溴化乙錠等核酸染料進(jìn)行染色,在紫外燈下觀察熒光亮度。通過(guò)比較待測(cè)樣本條帶與標(biāo)準(zhǔn)品條帶的熒光強(qiáng)度,可以對(duì)核酸含量進(jìn)行半定量估算。這種方法在驗(yàn)證核酸完整性、估算片段大小的同時(shí),也能提供含量參考,是理解測(cè)定核酸含量的方法及原理的直觀教學(xué)范例。
四、如何選擇合適的測(cè)定方法?
了解上述幾種測(cè)定核酸含量的方法及原理后,在實(shí)際應(yīng)用中應(yīng)如何選擇呢?
常規(guī)快速檢測(cè):對(duì)樣品純度有信心且需求量較大時(shí),可選擇紫外吸收法。
微量及高精度要求:當(dāng)樣品量稀少或含有干擾物時(shí),熒光染料法是理想的選擇。
完整性驗(yàn)證與半定量:需要同時(shí)觀察核酸降解情況及大致含量時(shí),瓊脂糖凝膠電泳非常實(shí)用。
總結(jié)
總結(jié)而言,掌握不同測(cè)定核酸含量的方法及原理,是進(jìn)行精準(zhǔn)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的基石。每種方法各有千秋,研究人員需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體需求,如靈敏度、精度、成本和時(shí)間等因素,來(lái)選擇合適的核酸含量測(cè)定方案,從而確保科研數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確與可靠。